После ответных матчей первого раунда Кубка УЕФА количество стран, участвующих в розыгрыше этого турнира, уменьшилось на треть – от 30 осталось 20. Жеребьевка группового этапа Кубка УЕФА состоится во вторник 4 октября в Швейцарии в 13:00 по киевскому времени. Все 40 клубов при жеребьевке будут распределены на 5 корзин по 8 команд в соответствии с клубным рейтингом УЕФА, сформированным по итогам пяти сезонов – с 2000/2001 по 2004/2005. В первой корзине будут первые 8 клубов по рейтингу и так далее. В полученных группах каждый из клубов проведет два матча дома и два – на выезде, а конкретное расписание домашних/выездных матчей станет известно лишь после жеребьевки, так как, в том числе, будут учитываться климатические условия. Оба украинских клуба, пробившиеся в групповой турнир - "Днепр" и "Шахтер" - будут определены в третью корзину, причем у "Шахтера" самый высокий рейтинг из этой корзины. Из каждой группы в 1/16 финала выходит по три клуба.

Корзина 1: ЦСКА (Россия), "Рома" (Италия), "Штутгарт" (Германия), "Монако" (Франция), "Герта" (Германия), "Локомотив"(Россия), "Бешикташ" (Турция), "Алкмар" (Голландия).

Корзина 2:"Севилья" (Испания), "Марсель" (Франция), ПАОК (Греция), "Славия" (Чехия), "Базель"(Швейцария), "Мидлсбро" (Англия), "Эспаньол" (Испания), "Ланс" (Франция).

Корзина 3: "ШАХТЕР" (Донецк), "Херенвен" (Голландия), "ДНЕПР" (Днеппропетровск), "Гамбург"(Германия), "Црвена Звезда" (Сербия и Черногория), "Болтон" (Англия), "Сампдория" (Италия), "Палермо" (Италия).

Корзина 4: "Стяуа" (Румыния), "Брондбю" (Дания), "Грассхоппер" (Швейцария), "Зенит" (Россия), "Левски"(Болгария), "Страсбур" (Франция), "Ренн" (Франция), ЦСКА (Болгария).

Корзина 5: "Гимарайнш" (Португалия), "Литекс" (Болгария), "Хальмстад" (Швеция), "Викинг" (Норвегия), "Динамо" Бх (Румыния), "Рапид" (Румыния), "Маккаби" П-Т (Израиль), "Тромсе" (Норвегия).