На Центральном Совете ПФЛ было принято решение внести изменения и дополнения в Регламент 2005/2006, которые приведут к реформировании первой и второй лиг на будущий сезон.

По итогам соревнований во вторую лигу переходят команды, занявшие 17-е и 18-е места в первой лиге. По итогам соревнований в первую лигу переходят команды, занявшие первые места в группах «А», «Б», «В» второй лиги, а также команда второй лиги, набравшая наибольшее количество очков среди команд, занявших вторые места в группах «А», «Б» и «В» второй лиги (подсчет ведеться по наименьшему количеству команд в группах). Даты окончания соревнований в первой и второй лигах – до 24 июня 2006 г.

Рабочая группа внесла такие предложения в Регламент 2006/2007 гг.: в соревнованиях первой лиги принимают участие 20 команд. В матчах команд первой лиги в каждой команде на поле должен пребывать один футболист в возрасте до 19 лет. По итогам соревнований в первую лигу переходят команды, занявшие первые два места в группах «А» и «Б» второй лиги. Соревнования второй лиги проводятся в двух группах («А» и «Б»), разделённых по территориальному принципу. В матчах команд второй лиги в каждой команде одновременно на поле должен пребывать один футболист в возрасте до 18 лет. По итогам соревнований во вторую лигу переходят команды, занявшие с 17-е по 20-е места в первой лиге